一些基层党组织的自身建设不仅没有起色，而且是每况愈下，一年不如一年。于是乎，脱离群众的事有之，干群关系紧张的事有之，工作落实不到位的事有之，干部职工思想严重退化的事也有之。
一是普遍对农村党建工作重要性认识不足。尽管近年来农村工作的实际充分证明，凡是党建工作抓得扎实的地方，都是经济社会发展较快的地方，也是党的各项工作推进得较好的地方。然而在现实工作中，很少有人去分析党建工作与促进经济工作本质的、内存的联系，往往犯一叶障目的错误，以经济工作代替党建工作。于是乎，在安排和落实党建工作时，往往以中心工作完成了多少、GDP增加了多少等经济指标来代替党建工作，对于如何通过党建工作抓好思想武装、转变干部工作作风、培养优秀干部来保证经济工作落实到位等一概不问等等。
二是没人抓党建工作。当前，农村工作的任务比较多，也很压头，安全生产、计划生育、社会治安综合治理、农业产业结构调整、农村危房改造、改厕改灶、党的建设等等，把人压得气都没法喘。然而当我们把各项工作横向比较一下，就会清晰的发现，党建工作根本就是一项没人抓的工作。比如说，安全生产工作重要，在一个乡镇至少有5至6人的编制，而且也有一支相对固定、工作能力相对较强的人员专抓该项工作;农业产业结构调整重要，各乡镇农业服务中心的编制都在10人以上，且也有一支相对固定、工作能力较强的队伍来抓该项工作，同时，这些站股的负责人也都是股级以上干部。而党建工作，一是没有人员编制，二是临时协调进党建办工作的人员也还要承包乡镇的其他中心工作，往往被中心工作弄得疲于奔命，根本就没法把精力放到党建工作上来，更为严重的是干脆把党建工作人员抽走。同时，乡镇党建工作人员大多没有经过专门训练，业务水平不高，只能做一些表册表卡统计等直观工作，对现行党建工作存在哪些问题、如何破解，既没有理论知识，也没有方法论的指导。笔者在调查中还发现，一些乡镇由于缺编严重，人手奇少，不得已只能抽调“一村一名大学生”或者安排“大学生志愿者”来负责该项工作。这些人员由于工作待遇相对较低，本身就是松散型管理，加上没有固定工作，多数都把精力投入到参加公务员考试的复习中，更使得党建工作缺乏应有的工作力量。党建工作在乡镇也就成了说起来重要、做起来次要、忙起来不要的可有可无工作。
三是党建工作的保障不够。在经费的投入使用上，由于乡镇财力紧张，大多都只是落实在年初的预算报告上，实际上根本就没有专款。虽然乡镇根据工作实际，明确党建工作经费为实报实销，然而，由于乡财政经常赤字，个人暂支的工作款往往拖了很长一段时间也报销不了，因而，工作人员在工作中也只能是心有余而力不足，有多少钱就办多少事，能做多少就做多少。在交通工具的保障上，党建工作没有工作用车，就连摩托车等简单的交通工具也没有，入村开展工作，不是协调其他站股的工作用车，就是借摩托车，或者就是徒步，使得在对一些村支部的工作指导上很不及时。在办公设施的投入使用上，党建工作很少有专门的工作项目，办公用微机等基本工作设施，只能是自行解决，基本没有上级给予匹配。
四是党务工作者没有相应的工作待遇。对于机关党组织来说，党务工作者的工作根本就不计入本人的工作量，繁重的党务工作让每一个党员都望而生畏;对于学校支部来说，党务工作者不仅在业务工作的量上没有任何减少，就是因党务工作突出而被评为先进等表彰也不能作为职称评定的参考，让很多党员不愿干党务工作。因此，在这一类党组织中，党员都不愿当支部书记，甚至有些人选为支部书记后，也还存在“上他人的当”等思想。在农村支部中，支部书记每月的工作报酬只有600元，有时还不够每月到乡镇开会的交通费和通信联系费。
五是党建项目与其他项目的整合不力。笔者认为，无论是村级组织活动场所改扩建的项目投入、还是村计生室、村卫生室、文化室、农村文化共享工程投入、远程教育投入等，都是新农村建设的投入，都要服从于、服务于新农村建设这一大前提，就要按新农村建设规划的前瞻性和整体性，扎实抓好项目的整合。然而在实际中，由于各项目整合不力，项目单位各唱各的调，各吹各的号，各村在实施这些项目中疲于奔命。为了赶进度、抓进程，结果是火烧眉毛??只顾目前，不管建设科学不科学、好用不好用，一味地按照上面的要求，随便找个地方建好完事，使得各项目建设不仅不规范，而且也难发挥其应有的作用，离新农村建设的要求甚远。
六是在党建工作的目的认识上有偏差。对党建工作在搞好党员的理论武装，调动党员干部工作积极性，培养带头致富、带领群众致富的科技致富带头人，转变工作作风，形成推动科学发展工作合力的认识不足，存在党建工作就是为了得到上级党组织照顾的思想，偏离了党建工作的目的。比如，在发展党员上，不是发展年纪轻、有能力、有知识、带富能力强的人员入党，而是发展年龄在40多岁、工作没有任何思路、发展能力一般的人员入党，一旦培养成熟，就成了老党员、困难党员，就指望每年上级党组织进行慰问、进行关怀等。
七是缺乏创新意识。当前，农村党建工作的限制很多，比如，在发展党员问题上，首先就要考察培养对象是否有违反计划生育的情况。凡是有违反计划生育政策的，便一味的进行否决。笔者认为，这是不科学的，也是一种没有创新意识的表现。违反计划生育的情况很多，比如不按间隔时间生孩子，这种问题是没有触及计划生育根本的，是可以对之进行教育、并做相关节育手续后纳入发展对象的;又如，有些群众超生后已做好结扎手续，只存在社会抚养费未交清的问题，也应大胆创新，积极把他们纳入发展对象。受传统党员教育管理思想的影响，很多支部对流动党员的管理也还只是支部主动抓，很不切合当前经济社会发展的实际。笔者认为在此种情况下，我们虽然不能直接对流动党员进行教育管理，但我们可变通一下，通过对流动党员的家人进行关怀、通过逢年过节流动党员回家给他们牵头结下帮扶对子等，让党员主动找组织，自觉接受党组织的管理。
八是组织活动开展较为困难。受地域环境的影响，各支部党员居住较为分散，有些村党员集中开会要走1-2小时的山路，使得组织活动特别难开展。
