学校以对接医药卫生健康产业为切入点，突出卫生职业教育特色，积极探索“产教融合、校企合作”办学模式，深入推进人才培养模式改革，牵头组建了赣州卫生职业教育集团，分别与赣州市人民医院、赣州市第五人民医院、赣州市肿瘤医院、赣州市妇保院等单位合作举办“定向班”，并以“订单班”、“冠名班”、“厂中校”等形式，与青峰医药集团有限公司、香港五色石集团有限公司、深圳金悠然科技有限公司等医药健康企业开展深入合作；2016年被国家残联、教育部确定“全国职业院校残疾人康复人才培养改革试点单位”，积极为地方经济社会发展提供有力的智力支持和人才支撑。
| 类别 | 专业 |
|---|---|
| 药品制造类(专) | 药品生产技术 |
| 护理类(专) | 护理 助产 |
| 药学类(专) | 中药学 药学 |
| 医学技术类(专) | 医学影像技术 医学美容技术 口腔医学技术 医学检验技术 |
| 康复治疗类(专) | 中医康复技术 康复治疗技术 |
截至2018年12月，学校设置有护理系、药学系、医学技术系、临床医学系、医学基础部、人文社科部（思政部）等6个专业系部，现开设护理、助产、药学、医学检验技术、康复治疗技术、医学美容技术、医学影像技术、口腔医学技术、中药学、药品生产技术和中医康复技术等11个高职专业，分别招收高中层次毕业生举办3年制高职教育和招收初中毕业生举办五年一贯制高职教育；并与南昌大学医学院、江西中医药大学、中南大学继续教育学院等联合办学，举办本科成人高等教育及自学考试助考，与上海交通大学医学院继续教育部联合举办了网络远程学历教育。
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