有分析指出，一些高校债务负担过重，也是高校学费上涨的原因之一。“近年来，学校建新校区，增加教学设备，提高教职工工资，花钱地方太多了，但国家财政拨款又有限。目前，省属高校基本都背着高额贷款甚至债务。”山东一所高校的老师透露。
生均教育培养成本上升、学校其他各项投入增加，都让不少高校支出增加。而从收入角度来看，尽管目前高校收入来源日益多元，但学费依然是高校收入的最主要构成。“一所运行合理的大学，其经费来源应该主要包括政府投入、学费、社会捐助和学校创收”，中国教育科学研究院研究员储朝晖说，“但中国高校的经费来源中，社会捐助和高校创收很少，运转主要靠政府和学费”。
教育部教育发展研究中心主任张力20日在接受人民网强国论坛访谈时也介绍，对于高校的“收”来说，大头是财政拨款，一般而言，尚未上涨的学杂费占高校总收入的1/4，有的一些省份为1/8，上涨之后的学杂费，在高校收入比重约为1/5到1/3。
因此，张力认为，学费上涨带有恢复性，其政策依据可以从教育规划纲要中找到一些答案。纲要中已明确讲到，要完善非义务教育培养成本的分担机制，根据经济发展状况、培养成本和群众承受能力，调整学费标准。
