| 学部 | 下设专业 |
| 临床医学一部 | 临床医学专业（温州市首批重点建设专业） |
临床医学二部 | 麻醉学专业 |
| 康复治疗学专业 | |
| 中医学专业 | |
| 临床医学专业（温州市首批重点建设专业） | |
人文与管理学部 | 市场营销 |
| 法学 | |
| 公共事业管理 | |
| 护理学部 | 护理学 |
| 口腔医学部 | 口腔医学 |
| 检验与生命科学学部 | 医学检验技术 |
外国语学部 | 日语 |
| 英语 | |
环境与公共卫生学部 | 应用心理学 |
| 环境科学 | |
药学部 | 中药学 |
| 药学 | |
信息与工程学部 | 生物医学工程 |
| 医学影像技术 | |
| 信息管理与信息系统 | |
| 基础医学部 | 法医学 |
重点专业：临床医学、中医学、口腔医学、护理学专业
温州医科大学仁济学院成立于1999年8月，是经教育部和省人民政府批准设立的，按新型办学模式和运行机制建立的全日制省属本科独立院校。2015年，成为浙江省首批加强应用型本科试点院校。2017年获批留学生招收资格。2018年9月，滨海校区正式启用，现有大一、大二3200余名学生在此就读。至此，学院拥有滨海、茶山、学院路三个校区，全日制在校生7200余人，现已成为浙江省医学人才培养的重要基地之一，是全国同类独立学院副理事长单位、独立学院医药院校委员会副会长单位。2020年，成为全国农村订单定向培养院校联盟理事长单位。
学院依托温州医科大学百余年的雄厚办学优势，根据经济社会发展的需求设置专业，现有医学、理学、工学、管理学、文学、法学6大学科门类25个本科专业，其中省重点学科1个、省十三五新兴特色专业3个，省一流专业3个，省、市精品课程9门，省一流课程5们，省级重点教材6部。学院馆藏纸质中外文图书62万余册。建有18个实验中心（室），在省内外合作建立了100余个校内外教学实习基地。
学院设有9个职能部门及14个学部。拥有一支德才兼备、实力雄厚的师资队伍，现有专任教师391人，其中具有博士、硕士学位的占90%以上，高级职称202人。一批优秀教师入选全国模范教师、全国高校优秀思想政治教育工作者、省卫生高层次创新人才、省高校中青年学科带头人、省新世纪151人才、省高校优秀教师、省师德标兵、教坛新秀等。获各级各类教育教学改革研究项目立项80余项，其中省级教育教学项目29项；获省级教学成果奖3项。
学院加强品牌专业的培养力度，开设了临床医学专业全科医学及精神医学方向、助产学专业。从2009年起，承担浙江省本科层次农村社区医生（临床医学、中医学、口腔医学、护理学专业）定向培养主要工作，致力于为区域医疗发展输送基层卫生人才，2012年在全省推广。目前已为基层输送了8届1273名全科定向毕业生。现有在校全科医学生近2600名，覆盖浙江省11个地市69个县（市、区），在全国医学院校中规模与影响力都居于首位。在人才培养过程中，创造性提出并实践全科医学人才培养与使用一体化的“国标省统、县管乡用”温医模式，为有效解决基层全科医生缺乏提供了解决方案，得到了国家领导及有关部委的充分肯定。“全科之声”入选首批浙江省高校党建特色品牌。
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