学校始建于1951年，前身为西南区川南医士学校，1959年升格并更名为泸州医学专科学校，1978年升格并更名为泸州医学院，1993年成为硕士学位授权单位，2001年开始联合培养博士，2003年开始留学生学历教育。更名为西南医科大学。
学校占地2011亩。在校本科生、研究生、留学生17005人。学校有专任教师1056人，其中博士241人;具有高级专业技术职务的专任教师495人，其中正教授135人；硕士生导师616人，博士生导师17人。有教育部“*”讲座教授、国家“百千万人才工程”第一、二层次人选、享受国务院政府特殊津贴专家等高层次人才356人次。
学校有硕士学位一级学科授权点7个，专业学位7个，省部级重点学科7个。有26个普通本科专业，其中国家特色专业3个，本科第一批次招生专业13个，双学位专业5个。学校是国家第一批“卓越医生教育培养计划项目”（2项）、“临床医学专业综合改革”、“临床医学硕士专业学位研究生培养模式改革”试点高校。有省级精品课程及精品资源共享课程26门，省级人才培养模式创新实验区2个、省级实验教学示范中心4个、省级虚拟仿真实验教学中心2个。是四川省卓越法律人才教育培养计划示范性实践教学基地。近两届获四川省高等教育教学成果奖一等奖3项。据国家考试中心数据显示，我校医学学科专业毕业生执业资格考试通过率在全国高等院校中名列前茅。
学校有教育部重点实验室、国家级博士后科研工作站、国家药物临床试验机构、省重点实验室、省科技基础条件平台等研究基地和机构，是“四川2011心血管疾病防治协同创新中心”牵头单位，有以医药、医疗器械研发为特色的省级大学科技园。近五年，获省部级科技成果奖24项，其中省政府一等奖3项、中华医学科技奖二等奖1项、三等奖2项，获得授权专利53项。
近年来，学校不断加强对外交流与合作，先后与美国、英国、加拿大、港澳台等23个国家和地区的高校、医疗卫生和科研机构建立了合作交流关系，积极开展联合培养博士、互访、教师培训、学生交流和科研合作。先后邀请了美国国立健康研究院、英国斯旺西大学等国外大学及科研机构的专家学者来校交流访问。先后举办了“中国酒城国际心血管研究高端论坛”、“第五届国际离子通道学术大会”、“肿瘤医学高端研讨会”等国际学术会议。
学校是四川省高等学校教育信息化示范学校。图书馆是四川省自动化、网络化建设优秀图书馆。
学校有三级甲等直属附属医院3所，有部省级医学学科17个，是国家全科医师规范化培训基地、国家或省级住院医生和专科医师规范化培训基地，是拥有4000多万人口的川滇黔渝结合区域的省级医疗卫生中心。
