当前学费：5000元/年（普通本科专业）
普通本科专业5000元/年；特殊（热门）专业6000元/年；艺术类专业10000元/学年；中外合作办学学费（中荷合作专业）15000元/年；高职学费7500元/年；中外合作办学学费（中美合作英语、会计专业）12000元/年。
中国高等航海教育发轫于上海，1909年晚清邮传部上海高等实业学堂（南洋公学）船政科开创了我国高等航海教育的先河。1912年成立吴淞商船学校，1933年更名为吴淞商船专科学校。1959年交通部在沪组建上海海运学院。2004年经教育部批准更名为上海海事大学。为更好地服务上海国际航运中心建设和国家航运事业发展，根据上海市高校布局结构调整规划，2008年上海海事大学主体搬迁临港新城。2009年学校举行百年校庆系列活动。
上海海事大学是一所以航运、物流、海洋为特色，具有工学、管理学、经济学、法学、文学和理学等学科门类的多科性大学。2008年，上海市人民政府与交通运输部签订协议，共建上海海事大学。
在2004年教育部本科教学工作水平评估和2006年教育部英语专业教学评估中获得优秀。，年度科技总经费达到2.8亿元，获一批国家级科研项目及部市级以上科技进步奖。
学校实行校院二级管理体制，现设有商船学院、交通运输学院、经济管理学院、物流工程学院（设中荷机电工程学院）、法学院、信息工程学院、外国语学院、海洋科学与工程学院、文理学院（设徐悲鸿艺术学院）、科学研究院、上海高级国际航运学院等二级办学部门。在21000余名学生中，有本科生17000余人，各类在校研究生3000余人，留学生600余名。在1100余名专任教师中，有教授156名，具有博士学位的教师比例约53%。学校致力于培养国家航运业所需要的各级各类专门人才，已向全国港航企事业单位及政府部门输送了大量毕业生，被誉为“高级航运人才的摇篮”。
学校2013年成立中国（上海）自贸区供应链研究院和上海高级国际航运学院。中国（上海）自贸区供应链研究院将自贸区建设与供应链研究有机结合，以提升自贸区产业链建设水平，促进自贸区货物贸易向服务贸易的转型发展，同时推动政府监管职能的转变。上海高级国际航运学院采取国际上先进的商学院运作模式，与全球优秀教育机构资源共享，着力打造国内领先、国际知名的航运金融教育品牌，构筑具有影响力的航运高端人才输出基地。
2008年，上海市教育委员会、上海市城乡建设和交通委员会、上海海事大学、虹口区人民政府等20多家单位共同发起成立上海国际航运研究中心。中心挂靠上海海事大学，是国际航运业发展的研究和咨询机构，为政府和国内外企业与航运机构等提供决策咨询和信息服务，是上海市教委首批建立的“高校知识服务平台”之一。，市教委将该平台挂牌为“上海市协同创新中心”。
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