目前有4所高校是中科院直属的，他们在全国甚至在全球也是很有名气的，实力相当强的。
一、中国科学院大学
简称“国科大”，始建于1978年，它是中国教育部批准成立的一所以研究生教育为主的高等学府。它的前身是中国科学院研究生院，也是中国第一所研究生院。第一个学位授权自主审核单位，培养了中国多个学术第一。有4个国家实验室、30个国家重大科技基础设施(大科学装置)、84个国家重点实验室、163个中国科学院重点实验室、41个国家工程研究中心。A+学科18个，实力相当的强。
二、中国科学技术大学
简称“中科大，创立于1958年，1970年迁到安徽省合肥市。世界一流大学建设高校、211工程、985工程。博士点28个，硕士点7个，重点学科18个，重点实验室5个。国家级重点专业有数学类、地球物理学、物理学、化学等等。中国科学技术大学的创办被称为“中国教育史和科学史上的一项重大事件”；建校后，中国科学院实施“全院办校，所系结合”的办学方针，汇集了严济慈、华罗庚、钱学森、赵忠尧、郭永怀、赵九章、贝时璋等一批著名科学家，建校第二年即被列为全国重点大学。A+学科7个实力也很强的。
三、上海科技大学
简称“上科大”，是一所由上海市人民政府与中国科学院共同举办、共同建设的高校。它与中国科学院所属研究院所开展科教融合。2013年-2016年，学校与中国科学院大学联合招收了4届硕博连读研究生。它采用小而精的模式办学，每年只招400个本科生。院校的教授都来自中科院的顶级教授，校长是*的儿子。实力不凡啊。
四、深圳理工大学
简称“中科院深理工”，过渡性校区也预计于今年底投入使用。过渡性校区（光明）主要用于中科院深理工正式校园建成之前，提前进行研究生的教育培养，同时吸引高水平人才落户。深圳理工大学预计在今年招收研究生，从研究生培养开始，逐渐招收本科生。学校将最终实现约8000至10000人的全日制在校生规模。
