南京医科大学双一流学科有1个，名单为公共卫生与预防医学，公共卫生与预防医学涉及流行病学、卫生统计学、卫生经济学、健康教育学等20多个学科。
| 序号 | 学科名称 |
| 1 | 公共卫生与预防医学 |
| 序号 | 学校 | 双一流建设学科 |
| 1 | 南京大学 | 哲学、理论经济学、中国语言文学、外国语言文学、物理学、化学、天文学、大气科学、地质学、生物学、材料科学与工程、计算机科学与技术、化学工程与技术、矿业工程、环境科学与工程、图书情报与档案管理 |
| 2 | 苏州大学 | 材料科学与工程 |
| 3 | 东南大学 | 机械工程、材料科学与工程、电子科学与技术、信息与通信工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、建筑学、土木工程、交通运输工程、生物医学工程、风景园林学、艺术学理论 |
| 4 | 南京航空航天大学 | 力学、控制科学与工程、航空宇航科学与技术 |
| 5 | 南京理工大学 | 兵器科学与技术 |
| 6 | 中国矿业大学 | 矿业工程、安全科学与工程 |
| 7 | 南京邮电大学 | 电子科学与技术 |
| 8 | 河海大学 | 水利工程、环境科学与工程 |
| 9 | 江南大学 | 轻工技术与工程、食品科学与工程 |
| 10 | 南京林业大学 | 林业工程 |
| 11 | 南京信息工程大学 | 大气科学 |
| 12 | 南京农业大学 | 作物学、农业资源与环境 |
| 13 | 南京医科大学 | 公共卫生与预防医学 |
| 14 | 南京中医药大学 | 中药学 |
| 15 | 中国药科大学 | 中药学 |
| 16 | 南京师范大学 | 地理学 |
南京医科大学（Nanjing Medical University）是首批教育部、国家卫生和计划生育委员会、江苏省共建高校和江苏高水平大学建设高校，是教育部“卓越医生教育培养计划”试点高校、国家建设高水平大学公派研究生项目实施高校、国家“特色重点学科项目”建设高校、中国政府奖学金来华留学生接收院校、江苏省高层次人才培养计划“333工程”培训基地，长三角医学教育联盟创始成员。
学校创建于1934年，时名江苏省立医政学院。1957年，由镇江迁至南京，更名为南京医学院。1962年，被列为全国首批六年制医药院校。1981年，被批准为全国首批博士、硕士学位授予单位。1993年，更名为南京医科大学。2015年9月，获准成为首批教育部、国家卫生计生委与省政府共建医学院校。
