| 二级学院 | 专业 |
| 护理学院 | 护理、助产等 |
| 药学院 | 药学、药物分析技术、药物制剂技术、药品经营管理、生物制药技术等 |
| 临床医学院 | 临床医学、康复治疗技术等 |
| 医学技术学院 | 预防医学、医学检验技术、医学美容技术、口腔医学技术、卫生信息管理、司法鉴定技术等 |
| 医学影像学院 | 医疗设备应用技术、医学影像技术等 |
| 康复医学院 | 康复医学等 |
| 国际教育学院 | - |
| 基础医学部 | - |
| 公共基础学院 | - |
国家重点建设专业：药学、医学影像技术专业
首批全国职业院校健康服务类示范专业点：护理
国家级实训基地：护理、现代康复实训基地
江苏省“十二五”高校重点专业群：护理专业（群）、药学专业（群）、康复治疗技术专业（群）
江苏省A类品牌专业：药学
江苏省特色专业：护理、康复治疗技术专业
江苏省实训基地：医药与食品检验检测技术实训基地、现代制药与药学服务综合实训基地。
江苏省成人高等教育重点专业（培育点）：护理、药学
江苏省成人高等教育精品资源共享课程（培育点）：基础护理技术、有机化学、药剂学、药理学、内科护理学
江苏医药职业学院是省卫健委直属全日制公办专科层次普通高等学校，是江苏省示范性高职院校和省市三方共建学校。学校前身为新四军军部于1941年7月创办的华中卫生学校，1958年成立盐城医学专科学校、盐城中医专科学校，1964年7月改办江苏省盐城卫生学校。1977年国家恢复高考制度后，较长时间承担普通大专及本科的培养任务。1996年开始五年制高职招生，开展高等职业教育。2005年3月18日经江苏省人民政府批准（苏政发〔2005〕25号）、教育部备案，升格为盐城卫生职业技术学院。2017年2月起更名为江苏医药职业学院。
学校坐落在风景秀丽、气候宜人的东方湿地之都、仙鹤神鹿世界??盐城。学校占地面积843.3亩，建筑面积28.57万平方米，固定资产总值超6亿元，教学设备总值1.44亿元，图书馆藏书75.46万册。有护理学院、医学院、药学院、国际教育学院等9个教学单位，开设护理学、临床医学、预防医学、中医学、药学等医药卫生大类专业19个。
学校是中国职教学会卫生教育专业委员会主任委员单位，全国卫生行指委康复治疗类专业教学指导委员会主任委员单位、全国食药行指委药学服务类专业教学指导委员会主任委员单位，全国医药卫生职业教育联盟发起单位和*团单位，江苏省医药职教集团副理事长单位和教学工作委员会主任委员单位、江苏省卫生高职院校教学协作会牵头单位。
学校不断深化教育教学改革，专业建设水平全面提升。获教育部《创新发展行动计划》认定骨干专业5个、省级A类品牌专业1个、首批全国职业院校健康服务类示范专业点1个、省高水平骨干专业5个、省高校重点专业群3个、省级特色专业2个、央财支持建设专业2个；有教育部职业教育专业教学资源库项目2个，国家级在线开放课程1门、省级在线开放课程15门、中国医学教育慕课联盟优秀在线课程项目2门，国家规划教材18本、省精品教材4本、省重点教材14本、“线上线下混合教学优秀典型案例”项目1项、教育部《创新发展行动计划》认定生产性实训基地2个，省产教深度融合实训平台建设项目2个、省产教融合实训集成平台项目1个；培育国家级、省级实训基地4个。
学校深入实施人才强校战略，师资队伍建设成效明显。现有校内外专、兼职教师944人，校内专任教师404人，其中教授32人、硕士学位以上教师324人，博士学位教师46人。有省优秀教学团队2个，省教学名师1人、省“333工程”（第三层次）培养对象7人、省“六大人才高峰”高层次人才5人、省“青蓝工程”中青年学术带头人6人和中青年骨干教师培养对象23人。
