部级重点研究基地8个，国家级实验教学示范中心1个，省级重点实验室3个，省级实践教学示范中心５个，省级产学研合作示范基地3个。吉首大学学报（社会科学版）为“全国中文核心期刊”、“全国百强社科学报”，吉首大学学报（自然科学版）为“全国高校特色科技期刊”。学校还是湖南省唯一的“省属高校少数民族预科教育基地”。
学校面向全国28个省（市）、自治区招生。现有各类在籍学生3.2万余人，其中全日制本专科生17000余人，硕士研究生600余人，招有韩国、美国等国留学生及交换生。此外，吉首大学张家界学院（三本独立学院）招有本科生7000余人。
办学50多年来，学校共培养各类高级专门人才90000余名。学校以“人文精神、科学素养、创新能力、务实作风”为培养目标，近5年来，学生参加各类竞赛共获国家级奖项70余项，省部级奖项120余项。学校的毕业生秉承“以人名校、以业报国”的校训，践行“凤飞千仞，薪传八方”的办学精神，以“下得去、留得注用得上、干得好”的过硬作风，深为社会和用人单位所欢迎，广大毕业生在祖国各地勤奋工作、建功立业，许多人现已成长为各级领导和各行各业的骨干力量。近年来，学校的毕业生就业率均保持在93％以上。
近5年来，学校承担各级各类科研课题860余项，其中国家自然科学基金课题20余项、国家社会科学基金课题80余项，并获国家教学成果二等奖2项，省级教学成果奖30余项，省部级科技成果奖50余项。学校在科研成果转化方面，取得了显著的经济和社会效益。具有自主知识产权的美味猕猴桃“米良1号”被国务院扶贫办列为扶贫开发项目，在全国16个省（市）推广栽种，仅湘西自治州种植面积就达10万余亩。从猕猴桃中提取的“果王素”经国内专家鉴定“达到国内领先水平，填补国际空白”，猕猴桃研究成果的产业化帮助湘西近20万农民摆脱贫困。湘西矿产资源和植物资源的研究成果已经孵化出近10家高新技术企业。湘西民族历史文化研究带动了湘西社会发展，推动了湘西旅游产业的蓬勃兴起。区域经济及开发模式研究多项成果被各级政府和企业采纳。
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