若按校友会版排行榜看，福建农林大学东方学院2017年全国排名第68位；全国排名第70位；2017年全国排名第83位；全国排名第92位；2013年全国排名第97位。以下是福建农林大学东方学院历年排名整理表：
| 年份 | 排名 | 院校 | 星级 | 所在地 | 类型 | 办学类型 | 办学层次 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2017 | 68 | 福建农林大学东方学院 | 3 | 福建 | 理工 | 应用型 | 中国知名独立学院 |
| 2016 | 70 | 福建农林大学东方学院 | 3 | 福建 | 应用型 | 中国知名独立学院 | |
| 2015 | 83 | 福建农林大学东方学院 | 2 | 福建 | 理工 | 应用型 | 区域高水平独立学院 |
| 2014 | 92 | 福建农林大学东方学院 | 1 | 福建 | 应用型 | 中国区域知名独立学院 | |
| 2013 | 97 | 福建农林大学东方学院 | 福建 |
若按金平果版排行榜看，福建农林大学东方学院2017年全国独立学院排名第174位；全国独立学院排名第137位；2017年全国独立学院排名第122位；全国独立学院排名第114位。以下是福建农林大学东方学院历年排名整理表：
| 年份 | 排名 | 院校 | 所在地 | 省排名 |
|---|---|---|---|---|
| 2017 | 174 | 福建农林大学东方学院 | 福建 | 7 |
| 2016 | 137 | 福建农林大学东方学院 | 福建 | 6 |
| 2015 | 122 | 福建农林大学东方学院 | 福建 | 6 |
| 2014 | 114 | 福建农林大学东方学院 | 福建 | 5 |
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