上海中医药大学王牌专业有中医学、中药学、中西医结合医学、康复治疗学、针灸推拿学、药学、康复作业治疗学、生物医学工程、护理学、康复物理治疗学等，可以算得上是最好的一些专业了，以下是具体名单一览表，供大家参考，如有变动，以学校最新公布为准。
1、一流本科专业建设点（国家级+市级）：
| 国家级一流专业 | 入选时间 |
| 中医学 | 2020 |
| 中药学 | 2020 |
| 中西医结合医学 | 2020 |
| 康复治疗学 | 2020 |
| 针灸推拿学 | 2021 |
| 药学 | 2022 |
| 康复作业治疗学 | 2022 |
| 上海市一流专业 | 入选时间 |
| 生物医学工程 | 2020 |
| 护理学 | 2020 |
| 康复物理治疗学 | 2022 |
| 食品卫生与营养学 | 2022 |
| 公共事业管理 | 2022 |
2、国家特色专业：中医学、中药学、针灸推拿学
3、重点学科
学科级别 | 个数 | 学科名称 | |
国家重点学科 | 一级 | 1 | 中药学 |
| 二级 | 3 | 中医内科学；中医外科学；中医骨伤科学 | |
| 培育 | 2 | 针灸推拿学；中医医史文献 | |
上海高校一流学科 | A类 | 1 | 中药学 |
| B类 | 3 | 中医学；中西医结合；科学技术史 | |
| B类培育 | 2 | 护理学；药学 | |
上海高校高峰高原学科 | I类高峰 | 3 | 中药学中医学、中西医结合 |
| I类高原 | 1 | 科学技术史 | |
国家中医药管理局重点学科 | 38 | 中医各家学说；中医诊断学；中医肝胆病学；中医肾病学；中医肿瘤病学； 中医肛肠病学；中医骨伤科学；针灸学；推拿学；药用植物学；中医药工程学； 中医传染病学；中西医结合临床（岳阳）；中医儿科学；中医神志病学； 古汉语与医古文；内经学；中西医结合基础；中医复杂科学；中医基础理论；中医史学；中医文化学；中医文献学；中医痹病学；中医疮疡病学；中医护理学（龙华）； 中医急诊学；中医乳腺病学；中医养生学；中西医结合临床（普陀）；中医全科医学； 中西医结合临床（曙光）；中医护理学（曙光）；中医药信息学；中医“治未病”学； 中医康复学；中医皮肤病学；中医血液病学 | |
上海中医药大学是教育部与上海市人民政府共建高校，上海市重点建设的高水平大学，国家首批世界一流学科建设高校，世界一流中医药大学建设联盟、长三角医学教育联盟创始成员，上海市高水平地方高校建设试点单位，首批世界卫生组织传统医学合作中心，国际标准化组织中医药标准技术委员会秘书处所在地；入选国家“111计划”、卓越医生（中医）教育培养计划、国家建设高水平大学公派研究生项目、国家“特色重点学科项目”、国家级大学生创新创业训练计划、新工科研究与实践项目、教育部人才培养模式创新实验区、国家理科基础研究和教学人才培养基地、国家大学生文化素质教育基地、中国政府奖学金来华留学生接收院校、上海市首批深化创新创业教育改革示范高校。学校与上海市中医药研究院合署运行。
学校创办于1956年，是新中国成立后国家首批建立的中医药高等院校之一。学校位于浦东新区张江综合性国家科学中心，地处张江科学城核心板块，占地500余亩。在全国第四轮学科评估结果中，中医学、中西医结合、中药学三个一级学科排名全国第一，均取得A+的优秀成绩，是全国中医院校中唯一取得3个A+的高校。
